Nghiên cứu được thực hiện trên quần thể: 50 gà Nhạn Chân Xanh (NCX), 10 gà Tre và 10 gà Ác, nuôi ở phía Nam nhằm đánh giá đa dạng di truyền của chúng thông qua 14 chỉ thị microsatellite được chọn lọc theo khuyến cáo của FAO. Số lượng alen, tần số dị hợp tử quan sát và dị hợp tử mong đợi, cũng như thông tin đa hình ở các quần thể được phân tích trên mỗi locus. Kết quả phân tích chỉ ra rằng trên quần thể gà NCX (i) số alen trung bình mỗi locus là 3,14; (ii) giá trị dị hợp tử quan sát (Ho) cao hơn dị hợp tử mong đợi (He) ở hầu hết các locus; (iii) Hệ số cận huyết trung bình (Fis) tương đối thấp (-0,09); (iv) Mức tương đồng di truyền giữa các phân nhóm phù hợp với phân bố địa lý ở 3 tỉnh khác nhau. Kết quả nghiên cứu cung cấp thông tin đa dạng di truyền cơ bản cho chương trình bảo tồn nhằm kiểm soát mức độ cận huyết và thực hiện các nghiên cứu di truyền tiếp theo ở gà bản địa Việt Nam nói chung và gà NCX nói riêng.