Đảng bộ Trường Đại học Cần Thơ được hình thành cùng với sự thành lập của Trường  Đại học Cần Thơ sau ngày giải phóng miền Nam, thống nhất đất nước; Chi bộ bộ Đảng đầu tiên được thành lập tháng 5 - 1975. Quá trình xây dựng và trưởng thành, dưới sự lãnh đạo của tổ chức Đảng, đặc biệt trong giai đoạn hiện nay, dưới sự lãnh đạo của Đảng ủy, Trường Đại học Cần Thơ đã khẳng định là cơ sở đào tạo đại học và sau đại học trọng điểm ở đồng bằng sông Cửu Long, là trung tâm văn hóa - khoa học kỹ thuật  của vùng. Tính đến đầu năm 2021, Đảng bộ Trường đã trải qua 12 kỳ Đại hội, Đảng bộ có 1.626 đảng viên với 36 Đảng bộ và chi bộ trực thuộc. Với số lượng cán bộ đảng viên và sinh viên rất lớn, việc triển khai, tuyên truyền thực hiện Chỉ thị 05-CT/TW là một trong những công tác luôn được Đảng ủy Trường quan tâm sâu sắc và đạt được kết quả quan trọng.