Nghiên cứu nhằm đánh giá năng lực vận hành của mạng lưới kênh mương đảm bảo yêu cầu về bảo tồn hệ sinh thái, đồng thời phòng chống cháy rừng tại vườn quốc gia Tràm Chim. Trong mùa khô mực nước được giữ ngập để phòng chống cháy rừng, nhưng với 5 phân khu có cao trình mặt đất khác nhau đang gây hại cho quần thể cây tràm, đặc biệt ở những phân khu có cao trình thấp. Chất lượng nguồn nƣớc mặt trong vườn biến động theo mùa trong năm, nguồn nước mặt có chất lƣợng trung bình vào mùa khô, tuy nhiên kém hơn vào mùa mưa do có sự trao đổi với hệ thống kênh mương ngoài vườn. Một số định hướng quản lý nước đã được đề xuất gồm cải tạo mạng lƣới kênh mương, chủ động kiểm soát luân phiên khô - ẩm theo bậc giữa các phân khu; quy hoạch các vùng sản xuất nông nghiệp để giảm lượng ô nhiễm phát sinh.