Tái cơ cấu ngành nông nghiệp, trong đó bao gồm lĩnh vực trồng trọt là nhiệm vụ quan trọng và cấp thiết của ngành nông nghiệp Việt Nam nhằm đạt được mục tiêu phát triển bền vững, nâng cao giá trị nông sản, phát triển nông dân và thành công xây dựng nông thôn mới. Để đạt được mục tiêu này, ngành trồng trọt đã có nhiều thay đổi trong cơ cấu cây trồng và mô hình sản xuất. Sự thay thế diện tích sản xuất lúa kém năng suất, hiệu quả thấp sang cây hoa màu, cây ăn trái bước đầu đạt được hiệu quả và triển vọng phát triển. Tuy nhiên, các mô hình sản xuất hiện này đều có ảnh hưởng nhất định đến môi trường thông qua lượng phát thải khí nhà kính trong quá trình canh tác. Nghiên cứu này trình bày tổng quan khía cạnh bảo vệ môi trường trong quá trình tái cơ cấu ngành nông nghiệp của Việt Nam, một số kết quả từ quá trình tái cơ cấu ngành trồng trọt, lượng khí nhà kính phát thải trong qua trình canh tác lúa nước, rau và cây ăn trái ở một số quốc gia, đề xuất giải pháp giảm thiểu phát thải khí nhà kính trong sản xuất.