Thức ăn tự nhiên đóng vai trò rất quan trọng trong nuôi trồng thủy sản, đặc biệt trong các giai đoạn ương, vèo và nuôi quảng canh cải tiến. Thức ăn tự nhiên bao gồm tảo, động vật phù du (luân trùng, trứng nước, giáp xác chân chèo…) và các nhóm động vật đáy (giun ít tơ, giun nhiều tơ, động vật thân mềm, giáp xác nhỏ…). Ở giai đoạn đầu của ấu trùng tôm, cá các nhóm động vật phù du (ĐVPD) là nguồn thức ăn rất quan trọng và không thể thay thế do chúng có kích thước nhỏ (kích thước của luân trùng dao động 50-500µm, trứng nước từ 300-1000µm…) phù hợp với giai

đoạn từ ấu trùng/bột lên hương/postlarave hoặc giống và giá trị dinh dưỡng cao nhất là hàm lượng các axit béo cao không no (HUFA như EPA, DHA, ARA) và nhiều enzyme cần thiết cho quá trình sinh trưởng, phát triển mà thức ăn nhân tạo không đáp ứng được.  Hầu hết các loài ĐVPD đều thích hợp cho ương cá bột, nhưng luân trùng và trứng nước (Moina sp.) được xem là các đối tượng nước ngọt tốt nhất có khả năng gia tăng hàm lượng protein và các giá trị dinh dưỡng khác cho cá bột.