Enzyme oxi-hóa ammonium (AMO=Ammonium monooxygenase) là enzyme cần thiết trong quá trình oxi hóa amoni (quá trình nitrat hóa), enzyme này được mã hóa bởi gen amo. Dựa trình tự gen putitative ammonia monooxygenase của Pseudomonas stutzeri A1501 trong ngân hàng dữ liệu, cặp mồi amo 1 được thiết kế để nhận diện gen amo trong P. stutzeri phân lập từ ao nuôi tôm sú ở đồng bằng sông Cửu Long. Bằng cặp mồi trên, 9/66 dòng (chủng) Pseudomonas stutzeri đã được phân lập mang gen amo và cả 9 dòng này đều có khả năng oxi-hóa ammonia trên môi trường tối thiểu bổ sung ammonium (từ 200 đến 700 mM).

Năm dòng gen amo khuếch đại từ DNA của chúng (ATCC14405, VT-B2a, TN9, TB3, TN4) đã được giải trình tự, so sánh các trình tự gen này trên ngân hàng dữ liệu bằng phần mềm BLAST N, BioEdit và xây dựng cây phả hệ bằng phần mềm MEGA 5.1. Kết quả cho thấy 4 gen từ chủng phân lập đều tương đồng với gen amo của dòng P. stutzeriA1501 ở mức 99% trong đó dòng VT-B2a và TN9 rất gần với dòng đối chứng ATCC14405 trong khi 2 dòng TB3 và TN4 ở một nhánh riêng. Hai dòng VT-B2a và TN4 được thử nghiệm xử lý amoni trong nước thải sinh hoạt và nước thải trại heo trong bình lên men 10-L, kết quả cho thấy cả hai dòng đều làm giảm hàm lượng amoni trong nước thải rất tốt (từ 170 ? 200 mg/l xuống.