Abstract

Tweenty bacterial isolates were isolated from diseased fish and shellfish together with 3 reference strains were examined phenotypically by biochemical characters and genotypically by ribotyping. Comparision based on 45 phenotypic characters by Euclidean distance with unweighted average linkage clustering (UPGMA) showed that these isolates mainly clustered in two groups. One group which consists of 14 isolates was equated with Aeromonas hydrophila. The remaining group comprising six isolates, did not establish any relationship with the included reference strains. Strains were also subjected to rRNA gene restriction pattern analysis (ribotyping), using SmaI as restriction enzyme. Twelve ribotypes were detected among studied isolates. Matrices of similarity coefficients between all possible pairs of strains were calculated and clustered according to the UPGMA as well. Similarity of ribotyping patterns between strains supported the phenotypic identification and performed its usefulness for the investigation of epidermiological relationship between studied strains.

Keywords: Aeromonas, fish disease, ribotyping, phenotyping, aquaculture,MekongRiverDelta

Title: Biochemical characters and ribotyping profiles of Aeromonas bacteria isolated from diseased fishes in aquaculture in theMekongRiverDelta,Vietnam 

TóM TắT

Đặc điểm chỉ  tiêu hình thái, sinh lý, sinh hoá và kiểu ARN ribosome của hai mươi chủng vi khuẩn phân lập từ bệnh phẩm thủy sản được xác định. Kết quả định danh bằng phương pháp phân tích cụm 45 chỉ tiêu về hình thái, sinh lý và sinh hóa của các chủng trên cùng với 3 chủng vi khuẩn chuẩn dựa vào khoảng cách Euclid-UPGMA cho thấy các chủng vi khuẩn nghiên cứu được phân thành hai nhóm chính. Một nhóm, gồm 14 chủng, được định danh là Aeromonas hydrophila. Nhóm còn lại gồm 6 chủng, không nhóm cùng với chủng nào trong số ba chủng chuẩn. Kiểu RNA ribosom của các chủng vi khuẩn được xáx định bằng enzym giới hạn SmaI. Có 12 kiểu ARN ribosom được phát hiện và được so sánh bằng hệ số tương quan Pearson để tính phần trăm đồng dạng giữa các chủng cũng bằng phương pháp UPGMA. Kết quả phân tích kiểu ARN ribosom giúp khẳng định kết quả định danh, đồng thời cho thấy kiểu ARN ribosom có thể được sử dụng để nghiên cứu quan hệ dịch tể của các chủng vi khuẩn nghiên cứu.

Từ khóa: Aeromonas, bệnh cá, kiểu ribosom, đặc điểm sinh hóa, nuôi thủy sản