Genetic diversity of 32 mangosteen accessions (Garciniamangostana L.) collected from Binh Dương was examined using Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) marker with 11 primers. The results showed 87 PCR amplified DNA products, including 40 polymorphic (45.98%) and 47 monomorphic products (54.02%). Among 11 primers tested, 10 ones gave polymorphic results in which ISSRED-14 primer showed high polymorphism results; this could be useful for genetic diversity study of mangosteen in the same geographic region. Analyzing by NTSYSpc 2.11a software with UPGMA method showed homology in these mangosteen accessions based ISSR marker varied from 0,75-1,00. Based on cluster analysis, these mangosteen samples could be divided into two large groups. The first group was genetic similarity about 75-89%.The second group with similar levels from 90,3 to 100% could be divided into four sub-clusters. The results suggested that the genetic diversity of 32 mangosteen accessions from Binh Duong was high although mangosteen belongs to opomictic plant. The genetic variation may be due to the accumulation of natural mutations to adapt to living environments.
Title: Genetic diversity of mangosteen (Garciniamangostana L.) varieties/accessions in Binh Duong based on the Inter Simple Sequence Repeat (ISSR) markers
TóM TắT
Đa dạng di truyền của 32 dòng măng cụt ở Bình Dương đã được kiểm tra bằng kỹ thuật ISSR với 11 cặp mồi. Kết quả PCR đã khuếch đại được 87 băng, trong đó có 40 băng thể hiện sự đa hình (45,98%) và 47 băng đơn hình (54,02%). Trong số 11 mồi thực hiện phản ứng có 10 mồi cho kết quả đa hình, trong đó mồi ISSRED-14 cho kết quả đa hình khá cao, có thể là mồi hữu dụng để nghiên cứu khác biệt di truyền giữa các dòng măng cụt trên cùng vị trí địa lý. Kết quả phân tích bằng phần mềm NTSYSpc 2.11a theo phương pháp UPGMA cho thấy mức độ tương đồng của 32 dòng măng cụt dựa trên dấu phân tử ISSR nằm trong khoảng 0,75-1,00. Dựa vào giản đồ phả hệ có thể chia 32 mẫu măng cụt thành 2 nhóm lớn. Nhóm thứ nhất có mức tương đồng di truyền nằm trong khoảng 75-89%. Nhóm thứ hai có mức tương đồng khoảng 90,3-100% và có thể được chia thành 4 nhóm nhỏ. Các kết quả trên cho thấy có sự khác biệt về mặt di truyền giữa 32 dòng măng cụt ở Bình Dương mặc dù măng cụt có hình thức sinh sản là vô tính. Sự biến đổi di truyền này có thể là do sự tích lũy đột biến tự nhiên để thích ứng với môi trường sinh sống của chúng.
Từ khóa: Garciniamangostana L., đa dạng di truyền, ISSR, măng cụt, đa hình
Trần Nhân Dũng, Đỗ Tấn Khang, 2012. ĐA DẠNG DI TRUYỀN CÁC GIỐNG XOÀI (MANGIFERA SP.) BẰNG KỸ THUẬT SINH HỌC PHÂN TỬ. Tạp chí Khoa học Trường Đại học Cần Thơ. 22a: 175-185
Trần Nhân Dũng, Đỗ Tấn Khang, Lương Thị Thu Thảo, 2012. KHẢO SÁT ĐẶC ĐIỂM DI TRUYỀN CỦA MỘT SỐ LOÀI THUỘC CHI ARTOCARPUS. Tạp chí Khoa học Trường Đại học Cần Thơ. 24b: 37-45
Tạp chí khoa học Trường Đại học Cần Thơ
Lầu 4, Nhà Điều Hành, Khu II, đường 3/2, P. Xuân Khánh, Q. Ninh Kiều, TP. Cần Thơ
Điện thoại: (0292) 3 872 157; Email: tapchidhct@ctu.edu.vn
Chương trình chạy tốt nhất trên trình duyệt IE 9+ & FF 16+, độ phân giải màn hình 1024x768 trở lên