Nghiên cứu được thực hiện nhằm đánh giá chất lượng nguồn nước sông dùng cho sinh hoạt và chăn nuôi. Các thông số được dùng khảo sát chất lượng nước sông như nhiệt độ, pH, ô xy hòa tan (DO), nhu cầu ô xy hóa học (COD), nhu cầu ô xy sinh hóa (BOD₅), coliforms tổng số, Escherichia coli, fecal coliforms và fecal streptococci. Kết quả nghiên cứu cho thấy nguồn nước sông được khảo sát ở Ninh Kiều và Bình Thủy đã ô bị nhiễm  phân từ động vật với chỉ tiêu vi sinh cao hơn so với tiêu chuẩn Việt Nam: QCVN 08-MT:2015/BTNMT và QCVN 01-  39:2011/BNNPTNT. Theo hai tiêu chuẩn này thì chất lượng nước mặt ở những sông này không đạt chuẩn dùng cho sinh hoạt của dân cư và chăn nuôi