The tfd genes mediating degradation of the herbicide 2,4-dichlorophenoxyacetic acid (2,4-D) differ in composition and organization in bacterial isolates from different geographical origin and are carried by different types of mobile genetic elements (MGE). It is not known whether such global diversity of 2,4-D-catabolic MGE and their tfd gene cargo is reflected in the diversity at field scale. The genomic context of the 2,4-D catabolic genes of 2,4-D-degrading isolates from two rice fields with a 2,4-D application history, located in two distant provinces of the Vietnam Mekong delta, was compared. All isolates were β-proteobacteria, were unique for each rice field and carried the catabolic genes on MGE and especially plasmids. Most plasmids were IncP-1β plasmids and carried tfd clusters highly similar to those of the IncP-1β plasmid pJP4, typified by two chlorophenol catabolic gene modules (tfd-I and tfd-II). IncP-1β plasmids from the same field showed small deletions and/or insertions in accessory metabolic genes. One plasmid belonged to an unclassified plasmid group and carries a copy of both tfdA and tfd-II identical to those in the IncP-1β plasmids. Our results indicate intra-field evolution and inter-field exchange of 2,4-D-catabolic IncP-1β plasmids as well as the exchange of tfd genes between different plasmids within a confined local environment.
Nguyễn Thị Phi Oanh, Line Nielsen, René De Mot, Paulina Estrada de los Santos, Dirk Springael, 2008. PHÂN TÍCH DI TRUYỀN KHẢ NĂNG DI CHUYỂN THEO PHENANTHRENE CỦA VI KHUẨN PSEUDOMONAS STUTZERI E1. Tạp chí Khoa học Trường Đại học Cần Thơ. 09: 136-144
Nguyễn Thị Phi Oanh, Dirk Springael, Hứa Văn Ủ, 2011. VI KHUẨN PHÂN HỦY 2,4-D TRONG ĐẤT LÚA Ở TIỀN GIANG VÀ SÓC TRĂNG. Tạp chí Khoa học Trường Đại học Cần Thơ. 18a: 65-70
Trích dẫn: Nguyễn Thị Phi Oanh và Nguyễn Thị Trúc Mai, 2019. Phân lập vi khuẩn có khả năng chuyển hóa nitrite trong một số ao nuôi tôm ở Bạc Liêu. Tạp chí Khoa học Trường Đại học Cần Thơ. 55(6B): 75-81.
Trích dẫn: Nguyễn Thị Phi Oanh và Nguyễn Lê Lam Ngọc, 2020. Phân lập và xác định đặc tính của vi khuẩn trong đất trồng nhãn có khả năng phân hủy potassium chlorate. Tạp chí Khoa học Trường Đại học Cần Thơ. 56(Số chuyên đề: Khoa học tự nhiên)(2): 80-88.
Trích dẫn: Nguyễn Thị Phi Oanh và Nguyễn Vũ Bích Triệu, 2017. Phân lập vi khuẩn phân hủy xylene từ hệ thống xử lý nước thải. Tạp chí Khoa học Trường Đại học Cần Thơ. 52a: 99-103.
Tạp chí khoa học Trường Đại học Cần Thơ
Lầu 4, Nhà Điều Hành, Khu II, đường 3/2, P. Xuân Khánh, Q. Ninh Kiều, TP. Cần Thơ
Điện thoại: (0292) 3 872 157; Email: tapchidhct@ctu.edu.vn
Chương trình chạy tốt nhất trên trình duyệt IE 9+ & FF 16+, độ phân giải màn hình 1024x768 trở lên