abstract

Twenty-two Japanese edamame varieties was characterized by 15 agro-morphology traits, 40 RAPD primers and 26 SSR primers to genetic diversity analysis. Among 35 morphometric descriptors, 22 were polymorphic (62,85%). Phenotypic diversity permitted some broad generalization and indicated the presence of important genes. A higher differentiation level was observed by using RAPD and SSR markers. RAPDs generated 219 amplification products of which 154 were polymorphic (70,32%) while SSRs produced 48 polymorphic bands out of 51 amplification products (94%). The UPGMA cluster analysis using 3 marker systems generated 4 distinct groups based on genetic dissimilarity with genetic distance from 4,47 to 10,50. It is suggested that the level of genetic diversity was sufficient for the efficent breeding program and can be used to establish genetic relationships among them with unknown or unrelated pedigrees.

Keywords: Edamame, genetic diversity, morphology, RAPD, SSR

Title: Genetic diversity based on morphology, RAPD and SSR analysis in Japanese vegetable soybean cultivars

Tóm tắt

Để làm cơ sở cho việc tuyển chọn giống đậu nành rau thích nghi với điều kiện đồng bằng sông Cửu Long, nghiên cứu đánh giá sự đa dạng di truyền của 22 giống đậu nành rau Nhật Bản dựa trên 15 tính trạng hình thái-nông học, 40 primer RAPD và 26 primer SSR đã được thực hiện. Có 62,85% đặc điểm hình thái-nông học được mô tả là đa hình. So với dấu hình thái, dấu RAPD và SSR đã chỉ ra mức độ khác biệt cao hơn và hiệu quả trong phân tích đa dạng di truyền: dấu RAPD với 70,32% đa hình và 94% dấu SSR là đa hình. Phân tích nhóm dựa trên 3 loại marker này đã phân 22 giống nghiên cứu thành 4 nhóm với khoảng cách Euclidean là 4,47-10,05. Mức độ đa dạng di truyền cho thấy sự khác biệt giữa các giống đủ để sử dụng cho việc chọn tạo giống mới. Bốn giống Wase edamame, Fusanari chamame, Chuse edamame và Yuusuzumi có quan hệ xa về mặt di truyền so với các giống khác và đây là nguồn vật liệu lai tạo quan trọng cho tương lai.

Từ khóa: Đậu nành rau, đa dạng di truyền, đặc điểm hình thái, RAPD, SSR