Việc nhận diện nhóm vi tảo biển dị dưỡng thraustochytrid bằng phương pháp truyền thống còn gặp nhiều khó khăn. Bằng quan sát hình thái dưới kính hiển vi quang học, 9 dòng vi tảo được cung cấp bước đầu được xác định là thuộc nhóm thraustochytrid. Trong nghiên cứu này, chín dòng vi tảo này đã được xác định thuộc chi thraustochytrium và Schizochytrium. Sử dụng 2 cặp mồi được thiết kế dựa trên trình tự vùng gen 18S rDNA của một số loài vi tảo mục tiêu. Trong đó, hai dòng vi tảo là M19 và D14 thuộc chi Thraustochytrium và bảy dòng còn lại thuộc chi Schizochytrium. Dựa vào việc so sánh kết quả phản ứng chuỗi trùng hợp với cặp mồi nhận diện Schizochytrium. Ngoài ra, ba dòng vi tảo được giải trình tự bằng cặp mồi Thraus-Schi 1 với kích thước khoảng 1.000 bp là B3, M6 và D14. Dựa vào phân tích cây phả hệ và kết quả tìm kiếm trình tự tương đồng từ ngân hàng gen NCBI (National center for Biotechnology Information), dòng B3 và M6 thuộc chi Schizochytrium và Aurantiochytrium (trong đó dòng B3 đồng hình cao với Schizochytrium sp. SKA10 ở mức độ 79% và dòng M6 ở mức 98% với  Schizochytrium sp. KRT1), và dòng D14 thuộc chi thraustochytrium, đồng hình ở mức 93% với Thraustochytrium sp. BP3.2.2. Các cặp mồi được thiết kế trong nghiên cứu này đã giúp nhận diện nhanh các dòng vi tảo thuộc thraustochytrid.