ABSTRACT

Tweenty bacterial strains isolated from roots and stem of wild rice, cultivated rice and weeds in rice field had similar characteristics to those of Azospirillum genus. Two specific primers 5?- GTA AAT CCA CCA CCT CCC -3? (forward) and 5?- TGT AGA TTT CCT GGG CCT -3? (reverse) were used to identify these strains. The results showed that 8/20 strains and the positive Azospirillum lipoferum strain had the same DNA band at the position of 400bp. Other strains did not have the same band with the control strain. Therefore, they were not belong to Azospirillum lipoferum species. Several studies need to be carried out to classify them before applying in the field.

Keywords: isolation, Azospirillum lipoferum, PCR, primer, gen nifH

Title: Isolation and identification of Azospirillum strains using PCR technique

TóM TắT

20 dòng vi khuẩn phân lập được từ rễ và thân lúa hoang, lúa trồng và một số loại cỏ ở ruộng lúa có các đặc tính giống như giống Azospirillum đã được mô tả bởi các tác giả khác. Sử dụng cặp mồi chuyên biệt khuếch đại gen nifH của loài vi khuẩn Azospirillum lipoferum, Mồi xuôi: 5?- GTA AAT CCA CCA CCT CCC -3?, Mồi ngược: 5?- TGT AGA TTT CCT GGG CCT -3? để nhận diện chúng bằng kỹ thuật PCR. Kết quả cho thấy có 8/20 dòng có các băng ADN ở vị trí 400bp giống như dòng vi khuẩn đối chứng Azospirillum lipoferum. Các dòng khác không có băng ADN tương ứng chứng tỏ chúng không thuộc loài Azospirillum lipoferum. Nhiều nghiên cứu cần được tiến hành trong tương lai để xác định các loài vi khuẩn còn lại trước khi ứng dụng thực tiễn.

Từ khóa: phân lập, Azospirillum lipoferum, PCR, mồi, gen nifH